준비 : 논문을 찾기위한 ScholarAI와 pdf문서를 요약하가 위한 AskYourPdf를 먼저 인스톨합니다(주: 인스톨이라고 하면 프로그램 설치가 연상되나, 정확하게는 실행가능 상태로 만드는 enable과정입니다)
AI korea community의 ChatGPT Plugin 모음집의 설명을 보겠습니다 ( ChatGPT plugin 모음집 다운로드 링크)
논문을 찾기위한 prompt
안과관련 유전자편집기술 관련 논문을 찾고 pdf를 요약하기 위한 프롬프트입니다
플로그인 경로 1: 논문 찾기
다음과 같이 ScholarAI를 아용해 논문을 찾고 그에 대한 출처를 보여주었습니다
안과 질환의 유전자 편집 치료와 관련된 논문은 다음과 같습니다:
1. 한스 클레버스의 오가노이드를 이용한 발달과 질병 모델링. (https://doi.org/10.1016/j.cell.2016.05.082)
이 논문에서는 오가노이드 기술을 유전자 편집과 결합하여 유전자 치료와 인간 장기 발달 및 다양한 인간 병리를 모델링하는 데 어떻게 사용할 수 있는지에 대해 설명합니다. 이 논문은 이 기술이 이제 막 탐색되기 시작한 많은 잠재적 응용 분야를 가지고 있음을 시사합니다. 전체 텍스트(http://www.cell.com/article/S0092867416307292/pdf)
2. 연령 관련 황반변성 치료를 위한 Cas9 리보핵단백질을 이용한 게놈 수술. 김경미, 박성섭, 김진수, 이승환, 김대식, 구태영, 김관근, 김정훈, 김진수 저. (https://doi.org/10.1101/gr.219089.116)
이 논문은 성인 실명의 주요 원인인 연령 관련 황반변성(AMD)과 CRISPR-Cas9 유전자가위를 이용한 RNA 유도 유전체 수술이 치료에 어떻게 활용될 수 있는지에 대해 중점적으로 다룹니다.
전체 텍스트(http://www.cell.com/article/S0092867416307292/pdf)
3. miR-184 종자 영역을 변경하는 돌연변이가 백내장을 동반한 가족성 원추각막을 유발함 Anne E. Hughes, Declan Bradley, Malcolm M. Campbell, Judith Lechner, Durga Prasad Dash, David Simpson, Colin E. Willoughby 저. (https://doi.org/10.1016/j.ajhg.2011.09.014)
이 논문에서는 조기 발병 전극성 백내장과 결합된 가족성 중증 원추각막의 원인이 되는 miR-184의 종자 영역 돌연변이에 대해 설명합니다.
전체 텍스트(http://genome.cshlp.org/content/27/3/419.full.pdf)
4. 신경계를 위한 유전자 치료: 도전 과제와 새로운 전략 Casey A. Maguire, Servio H. Ramirez, Steven F. Merkel, Miguel Sena-Esteves, Xandra O. Breakefield의 저서입니다. (https://doi.org/10.1007/s13311-014-0299-5)
이 리뷰에서는 유전자 기반 신경 치료제가 직면한 과제와 이러한 장벽을 극복하기 위해 고안된 현재 및 최근 전략을 요약합니다.
전체 텍스트(https://europepmc.org/articles/pmc4391389?pdf=render)
5. 생체 내 유전자 치료를 위한 CRISPR-Cas9: 약속과 장애물 웨이 다이, 주 리야오, 종이 얀, 용 쉬, 치롱 왕, 샤오지에 루. (https://doi.org/10.1038/mtna.2016.58)
이 글에서는 게놈 편집에서 CRISPR-Cas9의 메커니즘과 장점을 소개하고, 번역 가능성에 대한 도전 과제에 대해 논의하며 가능한 해결책을 제안합니다.
전체 텍스트 (https://europepmc.org/articles/pmc5023403?pdf=render)
이 논문들에 대한 자세한 내용을 원하시면 알려주세요.
Pdf 논문 다운로드 (수작업)
위의 검색중에 4번의 paper를 iCloud 다운로드 폴더로 다운받았습니다
플러그인 경로 2 : pdf 요약
1. Prompt : pdf 업로드 링크 요청
2. Pdf file 업로드 및 document id 확보
3. 확보된 documentID를 기반으로 요약 prompt
Pleas summarise below document
doc_id: a810b498-ee35-436b-8268-a89b7ce39628
AskYourPDF 사용
한스 클레버스의 "오가노이드를 이용한 발달 및 질병 모델링"이라는 제목의 문서에서는 배아 및 성체 포유류 줄기세포가 자기 조직화 특성을 나타낼 수 있도록 하는 3D 배양 기술의 발전에 대해 설명합니다.
이렇게 만들어진 오가노이드는 신장, 폐, 장, 뇌, 망막과 같은 장기의 주요 구조적 및 기능적 특성을 반영합니다. 다음은 문서의 주요 내용을 요약한 것입니다:
0페이지: 이 문서는 장기별 세포 유형으로 구성된 줄기세포에서 성장한 3D 구조물인 오가노이드의 역사와 잠재력에 대해 설명하는 것으로 시작합니다. 오가노이드는 만능 배아 줄기세포와 장기 제한 성체 줄기세포라는 두 가지 주요 유형의 줄기세포에서 시작될 수 있습니다. 두 접근법 모두 이러한 세포의 자기 조직화 특성을 활용합니다.
2페이지: 이 문서에서는 만능 줄기세포(PSC)로부터 성장시킬 수 있는 다양한 오가노이드의 개략도와 이에 사용되는 발달 신호에 대해 설명합니다.
7페이지: 이 문서에서는 낭포성 섬유증(CF)과 같은 질병을 모델링하는 데 오가노이드를 사용하는 방법에 대해 설명합니다. CF 환자의 iPS 유래 폐 오가노이드에서 CFTR의 표면 발현이 부재했지만 저분자 치료로 복원할 수 있었던 연구에 대해 언급하고 있습니다.
8페이지: 이 문서에서는 개인 맞춤 의학, 유전자 치료 및 재생 의학에서 오가노이드 기술의 잠재력에 대해 설명합니다. 이 문서에서는 CF 환자의 배양된 장 줄기세포에서 상동 재조합을 통해 CFTR 유전자좌를 교정하기 위해 CRISPR/Cas9 게놈 편집을 사용하는 것에 대해 언급하고 있습니다.
9페이지: 이 문서는 신경, 혈관, 면역 세포가 없는 등 현재 오가노이드 기술의 한계에 대해 논의하며 결론을 내립니다. 그러나 오가노이드의 강력한 자기 조직화 특성이 현재의 한계를 넘어 추가적인 세포 요소를 적절히 통합할 수 있을 것으로 예상하고 있습니다.
이 내용은 개괄적인 요약본이며 문서에 더 자세한 정보가 포함될 수 있습니다. 문서에서 특정 주제에 대한 정보가 필요한 경우 언제든지 문의해 주세요!
(주) 상기의 요약은 개괄적인 것이며, 필요할 경우, prompt를 통해 상세하게 요약할 수 있고, 페이지 단위로 상세화시킬 수도 있습니다.
Lessons Learned(교훈)
첫째: 논문의 검색후 pdf파일을 요약하기 위해서는 많은 시간을 들여 읽어봐야했으나 개괄적인 요약을 통해 논문의 줄거리를 이해한 다음에 상세한 내용을 프롬프트를 통해 좀 더 깊이 들여다볼 수 있게 되었으며 ChatGPT와의 대화를 통해 모르는 내용이 있을 경우 부가적으로 질문함으로써 이해의 폭을 넓히는 데 시간을 절약할 수 있게 되었습니다.
둘째 : 논문 검색의 폭이 넓어지고 빠르게 접근할 수 있게 되었다는 점에서 기본지식의 습득이 빨라지며 분야도 넓어졌다는 것입니다.
세째 : 핵심은 ChatGPT입니다. 결국 plugin이 대화를 이어갈 수 있는것이 아니기 때문에 ChatGPT와의 대화를 통해 연결된 논문검색 또는 pdf 번역 plugin을 충분히 활용할 수 있게 되었다는 것입니다. 이는 모든 plugin에 공통으로 적용된다는 점에서 지식노동자가 ChatGPT와 plugin을 어떻게 접목하고 활용하는지가 큰 경쟁력이 될 것이라고 추측해볼 수 있습니다.